Estimado Aliocha, ignoro en qué te has inspirado para plantear la pregunta, pero si la analizas con un poco de rigor podrás comprobar que es falaz. O sea, se dan dos premisas que se excluyen en un caso u otro: "el hombre piensa porque tiene alma", lo que se puede concebir como algo "irracional", es decir, no basado en la razón, en contraposición a "el hombre piensa porque tiene cerebro", lo que es una evidencia.

Pero ¿qué pasa con los animales superiores? todos tienen cerebro, pero carecen de raciocinio; todos tienen un "alma", pero carecen de espíritu. Por tanto, esta dicotomía es falsa de raíz.

Así, podemos empezar por establecer una diferencia entre ¿qué es un cerebro? ¿qué partes tiene? ¿cómo funcionan?, y ¿qué es la mente? ¿cómo es que la mente humana es racional utilizando un conjunto de cien mil millones de células, mientras que los animales carecen de esa mente racional?

Si lo consideras oportuno, el hilo conductor puede ir por ahí, no a través de una falacia materialista.

Saludos.